يهدف الجهاز بشكل عام من خلال متابعته لأداء الجهات الحكومية إلى تطوير الأداء ومحاربة مظاهر الخلل والقصور بجميع صوره وأشكاله سعياً للوصول إلى جهاز إداري قوي قادر على تلبية احتياجات المواطنين ملتزماً باللوائح والقوانين مواكباً للتطور التكنولوجي والتقنيات الحديثة في أداء أعماله.

ووفقا لدواعي إنشاء الجهاز بوصفه جهاز متابعة فإنه يسعى إلى وضع توصياته بالحلول والمقترحات التي قد تساعد على معالجة المشاكل والمعوقات التي يعاني منها الجهاز الإداري في الدولة ليشعر معها المواطن أن للحكومة جهاز يتابع تحقيق مصالحه واضعا أمامه المبادئ التالية:

1. تطبيق مبدأ الشفافية.
2. تحقيق العدالة وتكافؤ الفرص.
3. أهمية المساءلة واحترام القانون.
4. تعزيز قيم النزاهه في الجهات الحكومية.